MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014002	TTG	3	9	173070	173078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014002	ATGG	2	8	173090	173097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014002	TA	3	6	173098	173103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014002	GAA	2	6	173152	173157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014002	AAG	2	6	173170	173175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014002	ATA	2	6	173183	173188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014002	ATT	2	6	173227	173232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014002	GATA	2	8	173263	173270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014002	AGT	2	6	173308	173313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014002	GTA	2	6	173315	173320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014002	T	6	6	173376	173381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014002	ATTT	2	8	173388	173395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014002	TTTC	2	8	173435	173442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_014002	GGA	2	6	173452	173457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014002	T	6	6	176715	176720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014002	AT	3	6	176721	176726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014002	TTTGTT	2	12	176758	176769	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014002	ACCT	2	8	177713	177720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_014002	TAA	2	6	177871	177876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014002	G	6	6	177879	177884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014002	TAG	2	6	177943	177948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014002	TA	3	6	177972	177977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014002	A	7	7	177984	177990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014002	GAAG	2	8	178001	178008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014002	AAT	2	6	178055	178060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014002	TGTAT	2	10	178064	178073	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014002	TTG	2	6	178381	178386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014002	TTTTC	2	10	178400	178409	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
529	NC_014002	TAT	2	6	178498	178503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014002	TA	3	6	178629	178634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014002	TAAT	2	8	178652	178659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014002	CTT	2	6	178742	178747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014002	GAAT	2	8	178751	178758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014002	A	6	6	178836	178841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014002	CTT	2	6	178867	178872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_014002	TTG	2	6	178881	178886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014002	TTC	2	6	184292	184297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014002	CTGTG	2	10	184433	184442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
539	NC_014002	GTT	2	6	184467	184472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014002	TA	3	6	184496	184501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014002	GAA	2	6	185677	185682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014002	AACCG	2	10	188104	188113	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
543	NC_014002	TGC	2	6	191885	191890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014002	ATA	2	6	191909	191914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014002	ATA	2	6	192746	192751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014002	TGAA	2	8	192759	192766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014002	AT	4	8	192806	192813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014002	ATTT	2	8	193585	193592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014002	A	7	7	198232	198238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014002	TAA	2	6	200324	200329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014002	ATGGG	2	10	200340	200349	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014002	TA	3	6	200439	200444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014002	GGATG	2	10	203259	203268	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014002	CCAT	2	8	203586	203593	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_014002	AATC	3	12	203596	203607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_014002	TGG	2	6	203623	203628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014002	AAT	3	9	204966	204974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014002	CTC	2	6	205299	205304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_014002	ATC	2	6	205339	205344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014002	TGC	2	6	206282	206287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_014002	GGA	2	6	207666	207671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014002	TCC	2	6	208816	208821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_014002	ACT	2	6	208891	208896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014002	ATT	2	6	208906	208911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014002	ATT	2	6	209624	209629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014002	TCAA	2	8	209630	209637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_014002	TGA	2	6	209648	209653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014002	AAT	2	6	210179	210184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014002	AGG	2	6	210231	210236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014002	TGA	2	6	210247	210252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014002	ATTA	2	8	211956	211963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014002	CGG	2	6	212309	212314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014002	T	6	6	212327	212332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014002	CAA	2	6	212364	212369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014002	T	7	7	214169	214175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014002	TA	3	6	214184	214189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014002	AAT	2	6	214193	214198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014002	ATC	2	6	214205	214210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014002	ATT	2	6	214254	214259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014002	CCTT	2	8	216191	216198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_014002	T	6	6	216216	216221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014002	AATC	2	8	216226	216233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_014002	TTA	2	6	219221	219226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014002	ACC	2	6	219255	219260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_014002	TTA	2	6	219261	219266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014002	ATCA	2	8	221666	221673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_014002	TGG	2	6	221699	221704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014002	ACC	2	6	221716	221721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_014002	GGTAG	2	10	221773	221782	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014002	GTT	2	6	221877	221882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014002	ATT	2	6	221890	221895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014002	GAA	2	6	221981	221986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014002	TGT	2	6	221998	222003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014002	G	6	6	222032	222037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014002	TA	3	6	222247	222252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014002	GTA	2	6	222256	222261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014002	AAT	2	6	222266	222271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014002	ATT	2	6	222286	222291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014002	A	6	6	222342	222347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014002	A	6	6	222369	222374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014002	A	6	6	222389	222394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014002	GAA	2	6	222429	222434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014002	TGC	2	6	224376	224381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014002	TAA	2	6	224544	224549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014002	TTG	2	6	224570	224575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014002	TATT	2	8	224983	224990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014002	T	6	6	225003	225008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014002	TA	3	6	225028	225033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014002	ATTT	2	8	225046	225053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014002	AT	3	6	225074	225079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014002	AGG	2	6	225082	225087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014002	CCCT	2	8	226637	226644	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
613	NC_014002	T	6	6	226644	226649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014002	TA	3	6	226723	226728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014002	ATC	2	6	226737	226742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_014002	GAAC	2	8	226745	226752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_014002	TA	3	6	226805	226810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014002	AGG	2	6	226811	226816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014002	GGT	2	6	228449	228454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014002	CTT	2	6	228464	228469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014002	T	9	9	228468	228476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014002	ACA	2	6	231506	231511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_014002	CAT	2	6	231519	231524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014002	TCT	2	6	231539	231544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014002	T	6	6	231579	231584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014002	AT	3	6	231707	231712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014002	TTTTTC	2	12	233671	233682	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
628	NC_014002	AT	3	6	233692	233697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014002	AT	3	6	233828	233833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014002	GGT	2	6	233858	233863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014002	TCC	2	6	234055	234060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_014002	TGT	2	6	234061	234066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014002	T	6	6	234066	234071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014002	TATT	2	8	234092	234099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014002	ATT	2	6	236028	236033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014002	ATC	2	6	236091	236096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_014002	CCT	2	6	236155	236160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_014002	TA	3	6	236264	236269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014002	GCA	2	6	237049	237054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_014002	GCT	2	6	237061	237066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_014002	CT	3	6	237065	237070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
642	NC_014002	TTA	2	6	238709	238714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_014002	TCT	2	6	238872	238877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_014002	AAT	2	6	238902	238907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_014002	AT	3	6	241599	241604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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665	NC_014002	TA	4	8	241671	241678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_014002	TAT	2	6	252824	252829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_014002	ATT	2	6	289435	289440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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785	NC_014002	A	7	7	300459	300465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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